Третье постановление содержит указание о суровых карах по отношению к церковным судьям, которые вмешиваются в обычное судопроизводство. Изабелла весьма энергично выступила в защиту прав ординарных судов, считая, что тем самым она отстаивает государственные интересы. Подобная политика, которая является лишним свидетельством централизаторских стремлений королей, приводила к кровавым столкновениям. Коррехидор Трухильо задержал одного преступника, который потребовал передачи своего дела в церковный суд под тем предлогом, что он священнослужитель, и это привело к мятежу, вызванному и возглавленному духовными лицами. Изабелла направила в Трухильо войска, и мятеж был подавлен, причем королева приказала повесить главных зачинщиков-мирян, а участвовавших в смуте духовных лиц выслала из пределов страны. Только однажды королева отступила перед церковной юрисдикцией, и то из уважения к кардиналу Мендосе, архиепискому толедскому, который утверждал, что в пределах его диоцеза королевский суд функционировать не может. Но и в этом случае Изабелла не уступила полностью, а согласилась только на созыв комиссии законоведов, которой пору чено было рассмотреть конфликт, вызванный кардиналом. Все же церковные суды продолжали конкурировать с гражданскими трибуналами. Изъятия из юрисдикции короны попрежнему имели место, хотя они были и не столь значительны, как прежде.
Новая святая эрмандада (Santa Hermandad). Однако нормального судопроизводства было недостаточно, чтобы прекратить насилия, которые постоянно чинились в Кастилии то власть имущими людьми, то злоумышленниками и разбойниками, которым первые покровительствовали. Эрмандада Толедо (стр. 300) имела очень ограниченную сферу действия; Генеральная Эрмандада Кастилии и Леона прекратила свое существование после смерти Энрике IV. А так как гражданская война снова ввергла страну в состояние анархии и возросло количество разбойничьих шаек, то решено было воскресить это древнее учреждение, придав ему большую силу. Инициативу взяли на себя счетчик Алонсо де Кинтанилья и генеральный викарий Вильяфранки —Хуан де Ортега.