Следует иметь в виду, что Индии рассматривались как завоевание Кастилии, а не Арагона. Большой ущерб был причинен жителям Арагона монополией на погрузку и выгрузку всех товаров, ввозимых в Индии и оттуда прибывающих, которая дана была Кадису и Севилье. Депутаты из заморских владений, прибывшие в Испанию в 1508 г. для переговоров с королем, просили его разрешить уроженцам Кастилии и Арагона погрузку товаров, отправляемых в Индии, в любом порту Испании. На это Фердинанд не согласился, но разрешил им регистрацию и отправку грузов в упомянутых андалусских портах; при этом были освобождены от пошлин все товары, независимо от пункта их отправления, которые привозились в Севилью. Эта монополия объясняется не пристрастием к жителям Андалусии, но лишь стремлением централизовать надзор за экспедициями (порученный, как известно, Торговой Палате), с тем чтобы корона могла получать все причитающиеся ей пошлины и отчисления от прибылей. Король разрешил обитателям Эспаньолы сооружать корабли для каботажной торговли в пределах острова. Но он отложил выдачу разрешения на торговлю Эспаньолы с другими новооткрытыми землями впредь до получения необходимых сведений от правителя Индий.
Относительно эксплоатации рудников в системе коронной монополии, которая была при этом введена, речь уже шла выше. При пожаловании рудников частным лицам правительство сохранило за собой право на половину, а позднее на одну треть доходов. В 1508 г. Фердинанд назначил особое должностное лицо, которое ведало всеми рудниками, как уже открытыми, так и теми, которые могли быть введены в эксплоатацию в будущем. Этот чиновник обязан был наблюдать за разработкой рудников и охранять интересы королевской казны.