И действительно, вскоре последовало второе нападение французов (сентябрь). Им удалссь овладеть Фуэнтеррабией и другими пограничными пунктами (октябрь), в то время как часть королевских войск была занята подавлением восстания в Толедо. Наместники стремились собрать в Витории новые войска и укрепить Памплону. При решении первой задачи они столкнулись с большими трудностями ввиду полного отсутствия денег. Наместники рассчитывали на помощь местного населения и «в особенности знати», однако, во-первых, вспомогательное войско запоздало, а, во-вторых, оно скоро разбежалось—все. по той же причине, отсутствия средств и наличия раздоров между наместниками, затруднявших всякие решительные действия. Для выяснения обстановки король отправил в качестве своего специального уполномоченного дона Диего Уртадо. Однако тот ничего не смог сделать. Для исправления положения требовалось личное присутствие короля.
Но Карл надолго задержался в Германии, где обстановка была очень сложной и запутанной. Князья-избиратели заставили нового императора подписать компромиссное соглашение, содержащее различные статьи, которые, по курьезному совпадению, частично повторяли требования, выдвигавшиеся восставшими испанскими городами; статьи ограничивали некоторые права императора и были направлены к сохранению независимости от испанской короны. Эти предосторожности со стороны князей-избирателей были нелишними, так как, несмотря на пренебрежение Карла к испанцам, идеалом его политики был испаноцентризм. К испанской короне он присоединил бургундские владения и Северную Италию (см. ниже). Его заявления на имперском сейме в Вормсе были совершенно определенны. С другой стороны, считая, что императорская власть божественного происхождения, Карл открыто стремился к проведению абсолютистской политики, к укреплению своей личной власти и хотел покончить с самостоятельностью многочисленных мелких государств, составлявших тогдашнюю Германию. Против такой политики наверняка должна была возникнуть сильная оппозиция со стороны немецких владетельных князей.