С точки зрения формального права, Гетманщина сохраняла широкую автономию в управлении, системе экономических отношений, судопроизводстве, в собирании налогов и пошлин, прав всех сословий, имела 60-тысячный казачий реестр. В свою очередь, царь получил право держать в Киеве 15-тысячный гарнизон во главе с воеводой (город в связи с этим на 10 лет освобождался от уплаты налогов), контролировать связи гетмана с Польшей и Турцией (Б. Хмельницкий нередко пытался избежать этого), не платить жалованье казацкому войску. Стороны по-разному понимали договор и перспективы дальнейших взаимоотношений. Не случайно в сентябре 1655 года в титуле царя появились выражения «великий князь Литовский, Белой Руси, Волынский и Подольский», а мещане Переяслава еще в апреле 1654 года просили именно Алексея Михайловича снизить налог на производимое жителями пиво.

Внешняя политика В. Хмельницкого в 1654—1657 годах
С мая 1654 года войска России и полки наказного гетмана И. Золотаренко успешно действовали в Белоруссии против литовско-польской армии. Но попытки Б. Хмельницкого закрепить за собой белорусскую территорию встретили отпор царя, считавшего эти земли своими. Во взаимном соперничестве за подчинение населения Белоруссии и казацкие старшины, и русские воеводы допускали жестокость, грабили населенные пункты, силой принуждали жителей давать присягу на верность царю или гетману. Резкую реакцию Алексея Михайловича вызвало намерение Б. Хмельницкого включить в состав Гетманата пограничные с Украиной земли: в течение 1654—1656 годов гетман произвел красноречивые назначения: И. Золотаренко (погиб в октябре 1655 года) стал гетманом Сиверщины, И. Нечай — полковником белорусским, Д. Выговский — полковником быховским. Все они являлись родственниками Б. Хмельницкого по линии его жен или дочерей.
Весной 1655 года началось успешное генеральное наступление украинско-русских войск на Западной Украине. Однако в ноябре гетман вдруг прекратил бои за Львов, Самбор и сообщил шведскому королю Карлу X, что сделал это, чтобы избежать занятия городов армией царя.