Полномочия аудиенсий и вице-королей были во многомс ходны, в результате чего, несмотря на данную им власть, вице-короли были связаны в своих действиях аудиенсиями, так же как аудиенсий вынуждены были подчиняться контролю вице-королей даже в решении судебных дел Практически эта система противопоставления и взаимной зависимости оказывалась полезной лишь в немногих случаях. Развращенность административного аппарата, перешедшая из Испании в Америку, приводила к тому, что вице-короли и аудиенсий зачастую вступали в сделки с целью скрыть злоупотребления; если же вице-короли хотели избежать расследования со стороны королевской инспекции, они перекладывали на оидоров решение и тех правительственных дел, которые должны были решать сами, вместе со своими советниками.
Аудиенсий являлись высшей судебной инстанцией на подведомственной им .территории. Как мы уже говорили, первая аудиенсия находилась на острове Эспаньоле; ее действия определялись уставом 1528 г., в основном скопированным с устава Вальядолида и Гранады. Еще одна аудиенсия имелась в Мексике, а в XVI в. и в начале XVII в. были созданы аудиенсии в Панаме, Лиме, Сантьяго Гватемальском, Сайта Фе, Ла Плате, Кито, Сантьяго Чилийском и Тринидаде. Согласно уставу 1528 г., по гражданским делам можно было подавать апелляции в индийский совет и даже по уголовным делам давалось право обжалования или пересмотра.
Функции судов первой инстанции исполнялись судьями различных категорий или муниципальными капитулами, о которых будет сказано ниже. Таким образом, правители, коррехидоры, старшие и младшие алькальды, алькальды эрмандады и т. д., также как и в Испании, совмещали административные функции с судебными и занимались разбором апелляций, согласно своему месту в служебной иерархии. В работе аудиенсии участвовали также протекторы (защитники и представители индейцев), о которых мы уже говорили выше.
Титул «правитель» в применении к Индиям приобретал особый смысл; как известно, правителями называли самих вице-королей.