На севере страны город Витория, боясь графа Сальватьерра, оставался верным королю. Оставался верным и город Сан-Себастьян, несмотря на то что в провинции было некоторое количество сторонников комунерос, возбуждавших волнения. Наконец, в сентябре того же года стал относиться более сдержанно к тордесильясской хунте Вальядолид, подготавливая свой отход от движения. Главным доводом Вальядолида было то, что хунта создавалась только «для устранения тех обид, которые претерпело королевство, и для предотвращения их в дальнейшем», и в этом Вальядолид готов был оказывать поддержку, но никак не в том случае, «если из этого будет проистекать что-либо совсем иное».
Частично эти потери были восполнены тем, что к движению комунерос решительно примкнул епископ Саморы Акуыья во главе двухтысячной армии. Его поддержал также дон Педро Хирон, перешедший на сторону повстанцев из-за споров, касавшихся герцогства Медина Сидония. Хунта назначила его командующим войсками взамен Падильи. Кроме того, вспыхнули восстания в ряде местностей Каталонии, где повстанцы сумели возбудить народ. Все это, равно как и восстания в Валенсии и на Майорке, привело к раздроблению внимания и сил королевских властей.
Однако одно из этих двух благоприятных обстоятельств—переход дона; Педро Хирона на сторону повстанцев—принесло больше вреда, чем пользы, так как его назначение вызвало недовольство многих повстанцев и, в частности, Падильи. Впоследствии, как мы увидим, Хирон стал предателем.
Несмотря на то, что шансы короля и повстанцев примерно уравновешивались, губернаторы не принимали решительных мер, частично из-за отсутствия средств, частично в расчете на возможное соглашение. Один лишь коннетабль в начале октября стал стягивать войска для освобождения королевы Хуаны и для защиты совета. Адмирал завязал переговоры с хунтой, стремясь отговорить ее от намерения отстранить коннетабля от управления. Он призывал хунту к замирению страны и грозил в противном случае войной. Хунта отнеслась отрицательно к его предложениям.