Начальник посланного отряда, Лас Касас, основал город Трухильо (1525 г.). Третья экспедиция, под начальством самого Кортеса (1524 г.), преодолев огромные трудности, прошла через Табаско, Тепетитан, Ишталу, Акалам, озеро Петен, и, достигнув реки Пельочик (где была обнаружена одна из колоний, основанных Хилем Гонсалесом), спустилась вниз по течению реки до самого устья, где основала город Нативидад. Четвертая экспедиция, во главе которой стоял Уртадо де Мендоса, безуспешно обследовала берег Дарьенского залива. в поисках вожделенного пролива.
В 1527 г. Кортес отправился в Испанию, раздраженный прибытием в Мехико правительственного чиновника с полномочиями проверить его деятельность в связи с обвинениями против него, циркулировавшими при испанском дворе. Карл I принял Кортеса с большим почетом и сделал его. маркизом дель Валье де Оахака, наделив при этом большими земельными угодьями. Король возложил на него руководство всеми военными делами в Новой Испании, но изъял из его ведения гражданскую администрацию.
Вернувшись в Мехико в 1530 г., Кортес возобновил свои экспедиции (1532 г.), но теперь уже по направлению к северу и морским путем. В ходе этих экспедиций Уртадо де Мендосе удалось достичь Калифорнии; Грихальва и Акоста открыли острова Ревильяхихедо (1533 г.); самому Кортесу удалось подняться на 50 миль выше бухты ла Пас (1535—1537 гг.), а Ульоа достиг широты мыса Бахо. Но ни одна из этих экспедиций, полезных для географической науки, не дала новых колониальных приобретений.
Кортес хотел повторить экспедиции, но ему воспрепятствовал вице-король Новой Испании. Тогда Кортес решил отплыть в метрополию, чтобы подать жалобу королю. В 1540 г. он прибыл в Испанию. Король принял его очень холодно, а рассмотрение жалобы тянулось так долго, что Кортес так и не дождался решения. Он умер 2 декабря 1547 г. в возрасте 55 лет. Рассказывают, что однажды Кортес, желая поговорить с Карлом, подошел к подножке-королевской кареты. Карл, сделав вид, что не узнает его, спросил: «Вы кто такой?» На что Кортес гордо ответил: «Я тот, кто добыл вашему величеству больше областей, чем ваши предки оставили вам в наследство городов». Анекдот если и не достоверен, то во всяком случае правильно рисует характер короля.