Как бы то ни было, вопрос этот очень трудно решить с абсолютной достоверностью ввиду многочисленности ложных измышлений, распространявшихся Пересом, а также скудости документальных сведений.
Скитаясь по различным европейским дворам, Перес несколько раз делал попытки к примирению с Филиппом II, но все они кончались безрезультатно. Однако, с другой стороны, он не упускал ни малейшей возможности оклеветать своего бывшего повелителя. После смерти Переса его дети добились от сарагосской инквизиции полного отпущения грехов их отцу, заподозренному в ереси (18 июня 1615 г.).
Политика Филиппа III во Фландрии и Германии. 13 сентября 1598 г. Филипп II скончался от подагры, вызвавшей страшные язвы; боль он переносил с поразительным мужеством. Перед смертью он наказывал своему наследнику принцу Филиппу свято блюсти католическую веру и справедливо управлять своими подданными. Инфанте Изабелле, к которой перешли Нидерланды, он дал аналогичные наставления. К несчастью, наследник испанского престола не обладал качествами, необходимыми для разрешения серьезнейших политических проблем, возникших еще в правление Филиппа II, а передача Нидерландов инфанте Изабелле не освобождала Испанию от того тяжелого военного бремени, которое она вынуждена была нести в результате религиозной и в то же время освободительной борьбы нидерландского населения.
О Филиппе III его собственный отец говорил: «Господь бог, который дал мне столько владений, отказал в сыне, способном управлять ими... Боюсь, что им самим будут управлять другие!» Так и случилось. Новый король, в отличие от двух своих предшественников, всецело предоставил управление страной своему фавориту маркизу де Дениа, герцогу Лерме, который превратился во всесильного временщика, управлявшего государством по собственному усмотрению, не считаясь с королевским советом и с правом короля на последующее утверждение решений, сохранившимся только формально.