Там же, где власти были недостаточно энергичны, злоупотребления продолжались, причем виновные прибегали к испытанному способу защиты—скрывали от короля и совета по делам Индий истину (что подтверждается распоряжением 1530 г.) и угрожали расправой капитанам и лоцманам, которых подозревали в доставке донесений в метрополию, тем, кто писал о злоупотреблениях, а особенно тем, кто, подобно Лас Касасу, намеревался ехать в Испанию.
Несовершенство законов, касавшихся индейцев, вызвало в некоторых местах, например на Антильских островах, более или менее серьезные восстания индейцев. На Кубе, например, в 1538 и 1540 гг. происходили восстания, вызванные, по свидетельству главного алькальда, «дурным обращением с индейцами со стороны их хозяев» (отчет от 30 марта 1539 г.).
Рабы негры и гуанчес (guanches) Канарских и Филиппинских островов. Нам уже известно, что для замены вымерших индейцев на Антильские острова привозили рабов-негров, которых было в Испании немало, так как испанцы захватывали или покупали их в Африке с давних пор. Даже сам Лас Касас, убежденный защитник индейцев, не был последовательным и рекомендовал ввозить в Америку африканцев (правда, не с тем, чтобы торговать ими); впрочем, он вскоре раскаялся в ошибке и честно об этом зая вил.
Нашлись также люди, которые выступили в защиту негров, утверждая, что порабощение любого народа противно духу человеколюбия. Это были иезуит Авенданьо и Бартоломео де Альборнос—первые получившие известность противники рабства. Но их голос был гласом вопиющего в пустыне, и ввоз негров в Индии все усиливался.
Лицам, ввозящим негров, король Карл I (в дальнейшем его преемники придерживались той же системы) пожаловал ряд привилегий, лицензий и асиентос (asientos) (двухсторонние соглашения о поставках негров-рабов со взаимными правами и обязательствами, подобные капитуляциям времен конкисты), с монопольными правами или без них, в зависимости от обстоятельств. Первые лицензии король дал придворным, прибывшим с ним из Фландрии, в их числе Шьевру и многим другим фаворитам, как, например, правителю Бресы Лоренсо де Гувено, которому в 1518 г. была дарована монополия (в дальнейшем проданная им генуэзским купцам из Севильи) на ввоз в Америку 4000 негров.