Наконец, старшие алькальды городов и капитулов попрежнему ведали гражданскими и уголовными делами, хотя их права все больше ущемлялись указанными выше специальными чиновниками; то же можно сказать о коррехидорах, аделантадо и т. д.
Таково было положение судебных органов. Кроме того, нужно упомянуть об исключительных правах военных трибуналов, военных орденов, инквизиции и т. д. Так, например, на Канарских островах все дела распределялись между аудиенсией и генерал-капитаном, причем ведению последнего подлежали «все гражданские и уголовные процессы» по делам военных, а также «тяжбы и споры» между военными и крестьянами, проживавшими на островах.
К этому времени развернулась деятельность адвокатов и прокуроров как помощников правосудия. Представители и тех и других присутствовали в совете и апелляционных судах, причем специальной обязанностью некоторых из них было защищать и представлять бедноту. Аудиенсий и совет должны были утверждать адвокатов, прежде чем допускать их к выступлениям перед судом. Первые коллегии адвокатов были основаны в Сарагосе (1543 г.), Вальядолиде (1592 г.) и Мадриде (1595 г.).
Все эти судебные органы не смогли бы навести порядок в юридической жизни Испании, устранить давнишние злоупотребления, обеспечить гражданам общественное спокойствие и возможность пользования своими правами, если бы не принимались соответствующие меры и установления. О борьбе с опасностью неприятельского вторжения и о церковных трибуналах и церковном законодательстве мы будем говорить в соответствующем месте. Здесь же скажем о пенитенциарной системе. Положение ее было весьма плачевно. Вследствие продолжительных войн и гражданских междоусобиц, нищеты и общей распущенности нравов общественная безопасность свелась к нулю. Бандитизм попрежнему был страшной язвой всей страны, а непрерывные стычки воинственно настроенных идальго ежедневно обагряли кровью улицы и площади столицы и всех городов. Против этого государство было бессильно.