Если бы это произошло, то все усилия испанского короля помешать установлению протестантизма во Франции оказались бы напрасными. Но Генрих IV располагал поддержкой не только гугенотов, но и той части веротерпимых католиков, которые стремились к сохранению национального единства (конечно, при условии полного уважения католической церкви) и не желали установления испанского протектората. Крайние члены лиги, отчасти соглашаясь с намерениями Филиппа, считали, что именно он должен быть провозглашен французским королем. Однако вождь лиги герцог Майеннский (брат герцога Гиза) настоял на провозглашении королем кардинала Бурбонского, что было бесцельно, так как кардинал находился во власти Генриха IV, который не торопился выпустить его на свободу. Напротив, он усилил борьбу с лигой, одержал с помощью англичан ряд крупных побед (1590г.) ненова осадил Париж.
Тогда Филипп II решил активно вмешаться во французские дела, выдвинув претендентом на французский престол свою дочь Изабеллу, которую он прежде прочил в английские королевы. Филипп отдал приказ Фарнезе о вторжении во Францию и отправил ему денег для найма многочисленного отряда солдат. Фарнезе удалось достигнуть определенных успехов и даже снять с Парижа осаду (18 сентября 1590 г.). Но убедившись, что Майенн и другие члены лиги совсем не хотят видеть у себя на престоле испанцев, он оставил город, покинув лигу на произвол судьбы. Тогда Филипп II выдвинул другой план: разделить Францию между Испанией, герцогом Савойским и другими претендентами. Инфанта имела очевидные-права на герцогство Бретань, поэтому Филипп направил туда свои войска. Одновременно другие испанские войска вели ссаду Тулузы, а герцог Савой-ский действовал в Провансе. В войну вмешалась Елизавета Английская, опасавшаяся, что испанцы займут порты Бретани. Она послала на помощь Генриху IV трехтысячный отряд английских солдат. Вскоре во Францию снова был призван Фарнезе. Овладев Парижем, он двинулся на Руан, за который у него завязалась упорная борьба с Генрихом IV.