Также велика была роль пиратов в Средиземном море в конце XVII в., когда от королевского флота почти ничего не осталось.
Организация и вооружение морского флота. Пополнение личного состава флота производилось главным образом при помощи вербовки добровольцев; в 1590 г. была сделана попытка принудительного призыва во флот всех бродяг, но это дало мало результатов. В 1607 г. были введены матрикулы и «дан приказ, что лица не внесенные в матрикул, не смеют выходить на рыбную ловлю, а те, кто внесен, не могут отправляться в дальнее плавание без разрешения королевского коррехидора». Но это новшество вызвало такое негодование, что пришлось его отменить. При Филиппе IV матрикулы были введены снова как порядок, обязательный для всех побережий.
В 1554 г. месячное жалование маринеро (матроса высшей квалификации) равнялось 800 мараведи, грумета (палубного матроса)—533, юнги—266, мазстре или капитана—5200 мараведи. В 1663 г. маринеро получал 4 эскудо 4 реала, юнга—2 эскудо 2 реала, капитан флагманского корабля— 40 эскудо, остальные капитаны—30 эскудо. Нечего говорить о том, что зачастую плата эта являлась номинальной, так как в интендантстве флота царил такой же беспорядок, как и в армии. Вследствие этого, начиная со времен Карла I, во флоте неоднократно вспыхивали бунты. Герцог Осуна писал в начале XVII в., что на королевских судах можно было встретить «грудных младенцев, состоящих на жаловании, и солдат и матросов, которым жалование не выплачивалось по тридцать месяцев».
Часть морских сил составляли рыцари военных орденов, которым устав 1633 г. вменял в обязанность шестимесячную военную службу. Гребцы на галерах набирались из пленников и преступников, приговоренных к телесному наказанию, которое по приказу Карла I в 1530 г. было заменено отправкой на галеры. В уставе 1553 г. галерники фигурируют под общим названием сброд (chusma—преступники, приговоренные за тяжкие преступления, в том числе мориски, рабы—мавры и турки, изменники и люди дурного поведения).