Таким образом, несмотря на неосторожность своего посла в Лондоне Херау де Сесса (1568—1572 гг.), который по собственному почину вступил в заговор с Марией Стюарт против королевы Елизаветы, Филипп, во-первых, не упустил будущих возможностей и, во-вторых, не впитался преждевременно в это рискованное дело. Правда, в период своего пребывания во Фландрии Филипп II совещался с Альбой по вопросу о посылке войск в Шотландию.
Относясь с подозрением к намерениям Филиппа, Елизавета решила принять предупредительные меры и нанесла Испании чувствительный удар. В 1569 г., когда в английские порты укрылось от пиратов несколько испанских кораблей с деньгами для герцога Альбы, Елизавета приказала их захватить. Требование Испании о возвращении этих денег осталось без ответа. Херау, очень грубо ведший переговоры, приказал в виде ответных мер наложить эмбарго на собственность англичан, проживавших во Фландрии. В свою очередь Елизавета наложила эмбарго на имущество испанцев, проживавших в Англии. Против всеобщего ожидания, эти действия не привели к разрыву.
В 1570 г. имел место новый заговор Марии Стюарт, получивший поддержку Филиппа, которого в Мадриде посетил тайный агент Марии—итальянец Ридольфи. В заговоре был замешан испанский посол в Лондоне. Заговорщики замышляли убийство Елизаветы I и высадку испанских войск в Англии для оказания поддержки Марии Стюарт. Королевский совет одобрил план, но заговор провалился. Херау был выслан из Англии (март 1572 г.), после чего на семь лет были прерваны дипломатические сношения Испании € английским двором. Но и это не привело к войне, несмотря на то, что англичане всемерно поддерживали восставших голландцев, а английский флот систематически перехватывал испанские суда, шедшие из Америки, и совершал нападения на испанские колонии.
В те годы испанским агентом в Англии являлся ученый купец Антонио де Гуарас, проживавший там уже много лет. Антонио де Гуарас был связан с доном Хуаном Австрийским, который как раз тогда разрабатывал планы вторжения в Англию. Но, как уже было сказано, Филипп всегда решительно отвергал проекты своего брата.