Зато Филипп, хотя и косвенно, но все же поддержал две экспедиции в Ирландию, целью которых было поднять там восстание. Обе они закончились неудачно. Со своей стороны, Елизавета продолжала оказывать помощь голландцам и фламандцам, возобновила переговоры с Францией, направленные против испанского владычества в Нидерландах, и, кроме того, покровительствовала приору де Крату, укрывавшемуся в Лондоне.
Дипломатические отношения были возобновлены с прибытием в Лондон нового испанского посла дона Бернардино де Мендосы, который в скором времени начал переговоры с Марией Стюарт. Он убеждал ее отказаться от помощи Гизов и всецело довериться Филиппу. В 1580 г. Филипп окончательно склонился на сторону Марии Стюарт. Совместно с шотландскими католиками и иезуитами им был разработан обширный план, который предусматривал религиозную пропаганду в Шотландии, возведение на престол Марии, арест ее сына Якова (подозреваемого в протестантизме) и отправку его в Испанию, высадку испанских войск и организацию восстания в северной Англии, где католическая партия была особенно сильна. По неосторожности иезуитов, и вождя католиков в Шотландии план этот стал известен Гизам. Тогда Филипп снова отказался от него. Не получили одобрения Филиппа и новые попытки Марии, согласованные с французами (1583 г.), при этом король опирался на английских католиков, которые стояли за чисто испанскую акцию. Эта позиция, а также мнение маркиза де Санта Круса (уговаривавшего в 1583 г. начать войну с Англией) явились, повидимому, основанием к выработке того плана прямого вторжения в Англию, который позже был выдвинут Филиппом и который частично отражен в инструкциях, данных Филиппом своему послу в Париже в том же году. Сама по себе идея вторжения не была новостью. Еще в 1569 г. ее выдвигал герцог Альба. Несколько позже ею увлекался дон Хуан Австрийский, который вернулся к ней вновь в 1570 г. Но, повидимомуу вплоть до 1583 г. она не одобрялась Филиппом.
Вскоре из Англии был выслан испанский посол Мендоса (январь 1584 г.), замешанный в заговоре на жизнь Елизаветы; инициатором заговора были Гизы. Дипломатические отношения были прерваны вновь, и война началась, хотя формально она еще не была объявлена.