Различные экспедиции, направленные против них, по большей части удачные, не изменяли положения. Испанские колонии продолжали подвергаться нападениям. В 1665 г. дела испанцев еще более усложнились в связи с экспедицией, посланной Кромвелем на Ямайку. Захватив этот остров, англичане превратили его в центр своих операций против испанского флота и испанских портов в Америке.
В Азии и Океании положение было не лучше. Голландцы, хозяйничавшие на побережье Китая, Японии и на острове Тайвань, несколько раз нападали на Манилу, правда, безрезультатно. В 1626 г. испанцы в свою очередь захватили один порт на острове Тайвань, но уже в 1641 г. вынуждены были его оставить. В 1662 г. испанцы покинули Молуккские острова. В 1662 г. были оставлены также острова Коло и Минданао.
Борьба за колонии с внешними, главным образом европейскими, врагами осложнялась в ряде случаев военными и политическими событиями в самих колониях. В Мексике, где и раньше восставали рабы-негры, в 1624 г. против вице-короля было поднято крупное восстание, в котором приняло участие население столицы. Восстание явилось следствием ссор между вице-королем и местным архиепископом. В 1659 г. была предотвращена попытка поднять восстание, имевшее целью отделение Мексики от Испании. После казни вождя восстания Гильермо Ломбарде де Гусмана брожение прекратилось. В 1660 г. против испанцев восстали туземцы Техуантепека. Это вызвало большое беспокойство, но все было улажено мирным путем с помощью епископа Оахаки. В Чили война с арауканцами продолжалась до 1641 г. По условиям мирного договора народ этот признавался независимым и союзным Испании. Договор возобновлялся несколько раз, но тем не менее еще неоднократно происходили стычки, стоившие многих жертв.
На атлантическом побережье колонизации мешали нападения англичан (о чем мы уже говорили) и неожиданные нападения туземных племен, а также постоянная угроза районам, расположенным к северу от Ла Платы, со стороны португальцев.