Спасаясь от Сета, Исида прячет ребенка в зарослях папируса.
Второй тридцати двух метровый пилон храма, как и первый, украшен рельефами с изображениями царя. С восточной стороны двора находится портик с колоннами, вокруг которого расположены шесть небольших помещений. В одном из них находилась библиотека священных рукописей, пребывавшая под защитой Тота и богини Сешат. Ближайшая к пилону лестница ведет на крышу храма.
За пилоном находится гипостильный зал с десятью колоннами. На его плафоне можно увидеть грифов, расправляющих крылья, небесные барки и изображения богини Нут. На колоннах здесь сохранились следы краски, хотя в течение многих лет после строительства первой Асуанской плотины и до перенесения храмов на остров Агилкия Филэ ежегодно в течение девяти месяцев был затоплен.
Центральная часть храма состояла из двенадцати залов и наоса (№ 11), стены которого были покрыты рельефами. К западу от храма Исиды, слева от боковой стены второго пилона, находятся ворота Адриана (№ 12), во времена римских императоров Марка Аврелия и Луция Вера украшенные рельефами, сюжеты которых связаны с культом Осириса, и потому это сильно разрушенное строение иногда ошибочно называют часовней Осириса. Здесь есть любопытное изображение – пещера в скале, на вершине которой сидят сокол Хор и коршун Нехбет. Внутри пещеры – большая змея, защищающая Хапи и разлив Нила, который он вызывает. Бог держит в руках два сосуда, символизирующих истоки великой реки.
Рельефы на внешних стенах храма относятся к правлению римских императоров Августа и Тиберия. На севере находился воздвигнутый императором Клавдием храм Хорендота (Хора, защищающего своего отца Осириса) (№ 14), полностью разрушенный. Далее к северо-востоку располагаются руины храма Августа (№ 15) и ворота Диоклетиана. На острове также сохранились два ниломера, а в христианские времена здесь были построены монастырь и две церкви.